描述
一键对接 — AutoDock Vina 在线提供一个无缝的分子对接平台,消除了本地安装或 Linux 设置的需要。用户可以输入 PDB ID 和 SMILES,以接收包括亲和力表、2D/3D 相互作用图和适合论文的 PDF 在内的全面输出。该平台特别适合需要强大对接解决方案的学生和研究人员,无需软件安装的麻烦。
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对接过程涉及几个步骤:使用 Biopython 准备受体,使用 dimorphite-DL 和 RDKit 准备配体,以及使用 AutoDock Vina 进行对接。该平台支持刚性受体对接,确保蛋白质侧链保持固定,同时允许配体灵活性。用户可以从各种盒子源中选择以定义搜索框,并且平台在消耗积分之前提供 3D 预览。
一键对接提供有限积分的免费计划和多个付费订阅计划,包括学生、研究和实验室计划,每个计划提供不同的积分配额和功能。该平台还为需要额外资源的用户提供一次性积分包,而无需订阅。
结果以一个全面的 ZIP 文件形式交付,包含所有离线工作所需的数据,包括最佳构象、蛋白质-配体复合物和相互作用图。该平台还提供可选的 AI 手稿草稿,以帮助生成讨论和图例,尽管这些并不能替代专家编辑。
总体而言,一键对接 — AutoDock Vina 在线是一个强大的分子对接工具,为用户提供一个全面、易于使用的平台,支持广泛的对接需求。
- 类别科学发现与实验室工具
- 定价模式免费增值
- 部署云端
- 平台网页
一键对接的核心功能
AutoDock Vina 引擎
批量对接
PDB 准备
PDF 报告
PoseBusters QC
ADMET 分析
相互作用图
虚拟筛选
提供免费层
订阅计划
如何使用 一键对接?
输入 PDB ID:输入一个 4 个字符的 PDB ID 或上传一个 .pdb 受体。
提交配体:提供 SMILES 或 SDF 配体进行对接。
运行审查设置:验证设置而不消耗积分。
运行对接:执行对接过程并接收结果。
一键对接的使用案例
- 学术研究
- 药物发现
- 分子相互作用分析
- 论文准备
- 虚拟筛选







