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一键对接 — AutoDock Vina 在线

一键对接提供一个在线平台,使用 AutoDock Vina 进行分子对接。用户可以输入 PDB ID 和 SMILES,生成亲和力表、相互作用图和适合论文的 PDF,无需本地安装。

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一键对接 — AutoDock Vina 在线 截图
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一键对接 — AutoDock Vina 在线提供一个无缝的分子对接平台,消除了本地安装或 Linux 设置的需要。用户可以输入 PDB ID 和 SMILES,以接收包括亲和力表、2D/3D 相互作用图和适合论文的 PDF 在内的全面输出。该平台特别适合需要强大对接解决方案的学生和研究人员,无需软件安装的麻烦。

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对接过程涉及几个步骤:使用 Biopython 准备受体,使用 dimorphite-DL 和 RDKit 准备配体,以及使用 AutoDock Vina 进行对接。该平台支持刚性受体对接,确保蛋白质侧链保持固定,同时允许配体灵活性。用户可以从各种盒子源中选择以定义搜索框,并且平台在消耗积分之前提供 3D 预览。

一键对接提供有限积分的免费计划和多个付费订阅计划,包括学生、研究和实验室计划,每个计划提供不同的积分配额和功能。该平台还为需要额外资源的用户提供一次性积分包,而无需订阅。

结果以一个全面的 ZIP 文件形式交付,包含所有离线工作所需的数据,包括最佳构象、蛋白质-配体复合物和相互作用图。该平台还提供可选的 AI 手稿草稿,以帮助生成讨论和图例,尽管这些并不能替代专家编辑。

总体而言,一键对接 — AutoDock Vina 在线是一个强大的分子对接工具,为用户提供一个全面、易于使用的平台,支持广泛的对接需求。

  • 类别科学发现与实验室工具
  • 定价模式免费增值
  • 部署云端
  • 平台网页

  • AutoDock Vina 引擎

  • 批量对接

  • PDB 准备

  • PDF 报告

  • PoseBusters QC

  • ADMET 分析

  • 相互作用图

  • 虚拟筛选

  • 提供免费层

  • 订阅计划

  1. 输入 PDB ID:输入一个 4 个字符的 PDB ID 或上传一个 .pdb 受体。

  2. 提交配体:提供 SMILES 或 SDF 配体进行对接。

  3. 运行审查设置:验证设置而不消耗积分。

  4. 运行对接:执行对接过程并接收结果。

  • 学术研究
  • 药物发现
  • 分子相互作用分析
  • 论文准备
  • 虚拟筛选

一键对接 评价

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