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病毒人工智能

病毒人工智能是由DNAstack构建的全球联邦网络,用于基因组监测和传染病研究。它允许研究人员和公共卫生实验室浏览、搜索和查询由贡献组织共享的病毒基因组集合,而无需移动底层数据,并且已处理超过160万个SARS-CoV-2基因组。

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病毒人工智能是由DNAstack在其Omics AI平台上构建的基因组监测和传染病研究的联邦网络。它为研究人员和公共卫生实验室提供了一种浏览、搜索和查询全球贡献组织共享的病毒基因组集合的方法。

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由于该网络是联邦的,参与的实验室和机构可以连接并共享数据,而无需将其移出自己的系统,这使得敏感的基因组数据能够保持在其所有者的控制之下,同时仍然可以在网络中被发现和查询。该平台实施了全球基因组与健康联盟(GA4GH)和其他公认标准机构的开放标准,并以隐私、安全性和互操作性作为核心设计目标。

病毒人工智能通过其网络处理和共享了超过160万个SARS-CoV-2基因组。基于DNAstack的Omics AI平台构建的Genome Canada,利用该平台创建了一个国家级的、符合GA4GH标准的基于云的系统,用于处理和共享数十万个病毒序列。

病毒人工智能是为基因组研究人员、公共卫生当局和从事传染病监测的贡献实验室而构建的,而不是为普通消费者设计的,访问该平台是通过其贡献组织的网络进行,而不是通过典型消费者应用程序中找到的那种开放公共注册。

DNAstack将其更广泛的方法描述为按设计联邦:它连接、保护并使基于AI的发现能够在分布式数据集中进行,而无需将其移出源系统。病毒人工智能是DNAstack支持的几个此类研究网络之一,此外还有为神经科学和其他领域构建的类似结构的网络,所有这些都建立在相同的Omics AI平台上,并遵循DNAstack在其联邦网络产品中应用的开放标准和互操作性的承诺。该平台自己的数据目录清楚地描述了它:基因组监测和传染病数据,在选择参与的实验室和机构之间公开共享。

  • 类别科学发现与实验室工具
  • 部署云端
  • 平台网页版

  • 用于基因组监测和传染病研究的联邦网络

  • 在不移动源数据的情况下浏览、搜索和查询病毒基因组集合

  • 在贡献实验室和公共卫生组织之间共享数据

  • 基于GA4GH和其他开放基因组标准构建

  • 平台设计中融入隐私、安全性和互操作性

  • 处理和共享超过160万个SARS-CoV-2基因组

  • 支持国家基因组监测部署,例如Genome Canada的

  1. 作为贡献实验室加入:将组织的基因组数据连接到病毒人工智能网络。

  2. 浏览共享集合:探索其他贡献实验室共享的病毒基因组数据集。

  3. 搜索和查询:在网络中查找特定序列或基因组模式。

  4. 跟踪监测信号:关注与研究问题相关的病毒基因组数据趋势。

  5. 保持数据原位:数据保持在其自身系统内,连接但不复制,遵循联邦模型。

  • 疫情基因组监测
  • 国家基因组基础设施
  • 跨实验室研究查询

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