説明
MIMIC-III臨床データベースv1.4は、2016年9月4日にリリースされ、世界中の研究者にとって、実質的かつ自由に利用可能なリソースです。2001年から2012年の間にBeth Israel Deaconess Medical Centerの集中治療室でケアを受けた4万人以上の患者から匿名化された健康関連データが含まれています。この広範なデータセットには、患者の人口統計、毎時のバイタルサイン測定値、検査結果、処置および投与された薬剤の詳細、ケア提供者の記録、画像レポート、および病院退院後の死亡率データなど、幅広い情報が含まれています。
データベースは、SUBJECT_ID、HADM_ID、ICUSTAY_IDなどの識別子でリンクされた26のテーブルを持つリレーショナルデータベースとして構造化されています。集中治療情報システム（Philips CareVueおよびiMDsoft MetaVision ICU）、病院電子カルテデータベース、社会保障局死亡者名簿などのさまざまなソースからのデータが組み込まれています。データは、HIPAA基準に従って厳格な匿名化プロセスを経ており、構造化データのクリーニングと日付シフトが含まれ、患者の身元を隠蔽しながら間隔を保持します。日付は将来にシフトされ、89歳以上の患者の年齢は隠蔽されます。
MIMIC-IIIは、そのアクセシビリティ、代表するICU患者の大きくて多様な集団、およびデータの非常に詳細な性質で注目に値します。これにより、疫学、臨床意思決定ルールの改善、電子健康ツールの開発など、幅広い分析研究にとって貴重なツールとなります。データベースは、PostgreSQL、MySQL、MonetDBなどのさまざまなデータベースシステムへのインポート用スクリプトを伴うCSVファイルのコレクションとして提供されます。アクセスには、資格を持つユーザーが人間の研究参加者保護に関するトレーニングを完了し、データ使用契約に署名する必要があります。
バージョン1.4では、Metavision患者向けのドロップダウンメニューからのテキストデータの追加、データ範囲の修正、システム移行による欠損データの復旧、検査概念の調和、CSVファイルでのNULL値の表現の改善など、大幅な機能強化が行われました。また、退院サマリーへの追加情報を区別し、LOINCコードとタイムゾーンデータを修正しました。データベースは現在、Google Cloud Platform（GCP）およびAmazon Web Services（AWS）でも利用可能であり、それぞれBigQueryおよびAthenaでの使用チュートリアルが提供されています。
MIMIC-III Clinical Database v1.4のハイライト
40,000人以上のICU患者からの匿名化された臨床データ
人口統計、バイタルサイン、検査結果、薬剤、記録が含まれる
データは2001年から2012年までをカバー
世界中の資格を持つ研究者に無料で提供
HIPAA基準に準拠した厳格な匿名化プロセス
26のテーブルを持つリレーショナルデータベースとして構造化
Google Cloud Platform（GCP）およびAmazon Web Services（AWS）で利用可能
疫学、臨床意思決定ルールの改善、ツール開発の研究をサポート
毎時の生理学的測定値を含む、非常に詳細なデータ
入院中および退院後の死亡率データを含む
データはインポートスクリプト付きのCSV形式で提供
人間の研究参加者保護トレーニングの完了が必要
データ使用契約への署名が必要
MIMIC-III Clinical Database v1.4をはじめる
アクセス方法：physionet.orgにアクセスし、MIMIC-IIIデータベースを見つけます。
資格認定：必要なCITIデータまたは specimenのみの研究トレーニングを完了します。
データ使用契約：PhysioNet資格を持つ健康データ使用契約に署名します。
データダウンロード：承認後、PhysioNetWorksからデータベースファイルをダウンロードします。
データ統合：提供されたスクリプトを使用して、CSVデータを選択したデータベースシステムにインポートします。
データ分析：包括的な臨床情報を使用して研究を開始します。
MIMIC-III Clinical Database v1.4の使用例
- 臨床研究
- 意思決定支援ツール
- 機械学習モデル
- 再現性研究
- 電子カルテ分析
- 自然言語処理
