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ワンクリックドッキング — AutoDock Vinaオンライン

ワンクリックドッキングは、AutoDock Vinaを使用した分子ドッキングのためのオンラインプラットフォームを提供します。ユーザーはPDB IDとSMILESを入力することで、親和性テーブル、相互作用図、および論文提出用のPDFを生成できます。ローカルインストールは不要です。

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ワンクリックドッキング — AutoDock Vinaオンライン のスクリーンショット
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ワンクリックドッキング — AutoDock Vinaオンラインは、分子ドッキングのためのシームレスなプラットフォームを提供し、ローカルインストールやLinuxの設定を必要としません。ユーザーはPDB IDとSMILESを入力することで、親和性テーブル、2D/3D相互作用図、および論文提出用のPDFを含む包括的な出力を受け取ります。このプラットフォームは、ソフトウェアのインストールの手間をかけずに堅牢なドッキングソリューションを必要とする学生や研究者に特に有益です。

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ドッキングプロセスは、Biopythonを使用した受容体の準備、dimorphite-DLおよびRDKitを使用したリガンドの準備、AutoDock Vinaを使用したドッキングのいくつかのステップを含みます。このプラットフォームは、リガンドの柔軟性を許可しながら、タンパク質の側鎖を固定したままにする剛体受容体ドッキングをサポートしています。ユーザーは、検索ボックスを定義するためのさまざまなボックスソースから選択でき、クレジットを消費する前に3Dプレビューを提供します。

ワンクリックドッキングは、限られたクレジットを持つ無料プランと、異なるクレジットの許可と機能を提供する学生、研究、ラボプランを含むいくつかの有料サブスクリプションプランを提供しています。また、サブスクリプションにコミットせずに追加リソースが必要なユーザーのために、一度限りのクレジットパックも提供しています。

結果は、オフライン作業に必要なすべてのデータを含む包括的なZIPファイルで提供され、トップポーズ、タンパク質-リガンド複合体、および相互作用図が含まれます。このプラットフォームは、議論や図の説明を生成するのを支援するためのオプションのAI原稿草案も提供していますが、これらは専門的な編集の代替にはなりません。

全体として、ワンクリックドッキング — AutoDock Vinaオンラインは、分子ドッキングのための強力なツールであり、ユーザーに包括的で使いやすいプラットフォームを提供し、幅広いドッキングニーズをサポートします。

  • カテゴリー科学的発見・ラボツール
  • 料金モデルフリーミアム
  • デプロイクラウド
  • プラットフォームウェブ

  • AutoDock Vinaエンジン

  • バッチドッキング

  • PDB準備

  • PDFレポート

  • PoseBusters QC

  • ADMET分析

  • 相互作用図

  • バーチャルスクリーニング

  • 無料プランあり

  • サブスクリプションプラン

  1. PDB IDを入力: 4文字のPDB IDを入力するか、.pdb受容体をアップロードします。

  2. リガンドを提出: ドッキングのためにSMILESまたはSDFリガンドを提供します。

  3. レビューセットアップを実行: クレジットを消費せずにセットアップを検証します。

  4. ドッキングを実行: ドッキングプロセスを実行し、結果を受け取ります。

  • 学術研究
  • 薬剤発見
  • 分子相互作用分析
  • 論文準備
  • バーチャルスクリーニング

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