설명
원클릭 도킹 — AutoDock Vina 온라인은 분자 도킹을 위한 매끄러운 플랫폼을 제공하여 로컬 설치나 리눅스 설정의 필요성을 없앱니다. 사용자는 PDB ID와 SMILES를 입력하여 친화도 테이블, 2D/3D 상호작용 도형 및 논문 제출 준비가 완료된 PDF를 포함한 포괄적인 출력을 받을 수 있습니다. 이 플랫폼은 소프트웨어 설치의 번거로움 없이 강력한 도킹 솔루션이 필요한 학생과 연구자에게 특히 유용합니다.
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도킹 과정은 여러 단계로 구성됩니다: Biopython을 사용한 수용체 준비, dimorphite-DL 및 RDKit을 사용한 리간드 준비, 그리고 AutoDock Vina를 사용한 도킹입니다. 이 플랫폼은 단단한 수용체 도킹을 지원하여 단백질 측쇄가 고정된 상태에서 리간드의 유연성을 허용합니다. 사용자는 검색 상자를 정의하기 위해 다양한 박스 소스 중에서 선택할 수 있으며, 플랫폼은 크레딧을 사용하기 전에 3D 미리보기를 제공합니다.
원클릭 도킹은 제한된 크레딧을 제공하는 무료 플랜과 학생, 연구 및 실험실 플랜을 포함한 여러 유료 구독 플랜을 제공합니다. 각 플랜은 서로 다른 크레딧 허용량과 기능을 제공합니다. 또한, 플랫폼은 구독에 가입하지 않고도 추가 리소스가 필요한 사용자에게 일회성 크레딧 팩을 제공합니다.
결과는 오프라인 작업에 필요한 모든 데이터를 포함하는 포괄적인 ZIP 파일로 제공되며, 여기에는 상위 포즈, 단백질-리간드 복합체 및 상호작용 다이어그램이 포함됩니다. 플랫폼은 또한 논의 및 도형 설명 생성을 지원하기 위해 선택적 AI 원고 초안을 제공하지만, 이는 전문가 편집의 대체물이 아닙니다.
전반적으로 원클릭 도킹 — AutoDock Vina 온라인은 분자 도킹을 위한 강력한 도구로, 사용자가 다양한 도킹 요구를 지원하는 포괄적이고 사용하기 쉬운 플랫폼을 제공합니다.
- 카테고리과학적 발견 및 실험실 도구
- 요금제프리미엄
- 배포클라우드
- 플랫폼웹
원클릭 도킹의 핵심 기능
AutoDock Vina 엔진
배치 도킹
PDB 준비
PDF 보고서
PoseBusters QC
ADMET 분석
상호작용 다이어그램
가상 스크리닝
무료 티어 제공
구독 플랜
원클릭 도킹 사용 방법은?
PDB ID 입력: 4자 PDB ID를 입력하거나 .pdb 수용체를 업로드합니다.
리간드 제출: 도킹을 위한 SMILES 또는 SDF 리간드를 제공합니다.
설정 검토 실행: 크레딧을 사용하지 않고 설정을 검증합니다.
도킹 실행: 도킹 프로세스를 실행하고 결과를 받습니다.
원클릭 도킹의 사용 사례
- 학술 연구
- 약물 발견
- 분자 상호작용 분석
- 논문 준비
- 가상 스크리닝
