الوصف
خادم AlphaFold هو خدمة ويب تولد توقعات دقيقة للغاية لهياكل الجزيئات الحيوية، بما في ذلك البروتينات، الحمض النووي، RNA، الروابط، والأيونات. إنه مدعوم من أحدث نموذج AlphaFold 3، الذي يعزز القدرة على نمذجة التفاعلات المعقدة للجزيئات الحيوية. يمكن للمستخدمين إدخال أنواع مختلفة من الجزيئات البيولوجية والحصول على توقعات مفصلة حول هياكلها وتفاعلاتها.
قراءة المزيد
يسمح الخادم بنمذجة الهياكل التي تتكون من عدة جزيئات بيولوجية، بما في ذلك البروتينات، الحمض النووي، RNA، ومجموعة متنوعة من الروابط والأيونات. يدعم مجموعة واسعة من الروابط والأيونات الشائعة بيولوجيًا، بالإضافة إلى التعديلات بعد الترجمة للأحماض الأمينية والأحماض النووية. عملية النمذجة محدودة بنظام الرموز، حيث يتم تحديد الحجم الإجمالي للعمل بـ 5,000 رمز، مما يضمن معالجة فعالة وتوقعات دقيقة.
تم تصميم خادم AlphaFold للاستخدام غير التجاري ويتطلب من المستخدمين الالتزام بشروط خدمة محددة. يمكن للمستخدمين تشغيل ما يصل إلى 30 عملاً في اليوم، مع خيار حفظ الأعمال وتقديمها لاحقًا إذا تجاوزوا حصتهم. يوفر الخادم أيضًا مقاييس الثقة للتوقعات، مما يسمح للمستخدمين بتقييم موثوقية الهياكل الناتجة. تشمل هذه المقاييس درجات pLDDT، PAE، pTM، وipTM، التي تساعد المستخدمين في تفسير دقة الهياكل المتوقعة.
بالنسبة لأولئك المهتمين بتخصيص توقعاتهم، يقدم خادم AlphaFold خيارات لاستخدام قوالب مخصصة ومحاذاة تسلسلات متعددة (MSAs). يمكن للمستخدمين تحميل قوالبهم الخاصة وMSAs لتعزيز عملية التوقع، مما يجعله أداة متعددة الاستخدامات للباحثين في مجال نمذجة الجزيئات الحيوية.
- الفئةالاكتشاف العلمي وأدوات المختبر
- نموذج التسعيرمجاني
- النشريعمل عبر الويب
- المنصاتسحابي
الميزات الأساسية لـ خادم AlphaFold
توقعات دقيقة للهياكل
يدعم البروتينات، الحمض النووي، RNA، الروابط، الأيونات
قوالب مخصصة وMSAs متاحة
مقاييس الثقة المقدمة
استخدام غير تجاري فقط
حد 30 عملاً في اليوم
حد الرموز 5000
واجهة قائمة على الويب
كيفية استخدام خادم AlphaFold؟
إدخال أنواع الجزيئات البيولوجية: أدخل البروتينات، الحمض النووي، RNA، أو الروابط المطلوبة.
تخصيص القوالب: قم بتحميل قوالب مخصصة إذا لزم الأمر لتوقعات محددة.
إعداد MSAs: قدم محاذاة تسلسلات متعددة مخصصة لتعزيز دقة التوقع.
تقديم العمل: قم بتشغيل عمل التوقع وانتظر معالجة النتائج.
حالات استخدام خادم AlphaFold
- نمذجة تفاعل البروتينات
- توقع هيكل الحمض النووي
- تحليل تفاعل RNA
- دراسات ارتباط الروابط
- نمذجة التعديلات الكيميائية
