Описание
Вирусный ИИ — это федеративная сеть для геномного наблюдения и исследований инфекционных заболеваний, созданная компанией DNAstack на платформе Omics AI. Она предоставляет исследователям и лабораториям общественного здравоохранения возможность просматривать, искать и запрашивать коллекции вирусных геномов, предоставленные участвующими организациями по всему миру.
Читать далее
Поскольку сеть является федеративной, участвующие лаборатории и агентства подключаются и обмениваются данными, не перемещая их из своих систем, что позволяет чувствительным геномным данным оставаться под контролем их владельцев, оставаясь при этом доступными и запрашиваемыми по всей сети. Платформа реализует открытые стандарты от Глобального альянса по геномике и здоровью (GA4GH) и других признанных стандартных организаций, и построена с учетом конфиденциальности, безопасности и совместимости как основных целей проектирования.
Вирусный ИИ обработал и поделился более 1,6 миллиона геномов SARS-CoV-2 через свою сеть. Genome Canada, одна из организаций, созданная на основе платформы Omics AI от DNAstack, использовала ее для создания национальной облачной системы, соответствующей стандартам GA4GH, для обработки и обмена сотнями тысяч вирусных последовательностей.
Вирусный ИИ предназначен для геномных исследователей, органов общественного здравоохранения и участвующих лабораторий, работающих в области наблюдения за инфекционными заболеваниями, а не для общего потребителя, и доступ к платформе осуществляется через сеть участвующих организаций, а не через открытые публичные регистрации, которые можно найти в типичном потребительском приложении.
DNAstack описывает свой более широкий подход как федеративный по дизайну: он соединяет, защищает и позволяет делать открытия на основе ИИ через распределенные наборы данных, не перемещая их из исходных систем. Вирусный ИИ является одной из нескольких таких исследовательских сетей, которые поддерживает DNAstack, наряду с аналогично структурированными сетями для нейронауки и других областей, все построены на одной и той же основной платформе Omics AI и с тем же обязательством к открытым стандартам и совместимости, которые DNAstack применяет в своих федеративных предложениях. Собственный каталог данных платформы описывает его просто: геномное наблюдение и данные об инфекционных заболеваниях, открыто делящиеся между лабораториями и агентствами, которые выбирают участие.
- КатегорияНаучные открытия и лабораторные инструменты
- РазвёртываниеОблако
- ПлатформыВеб
Основные функции Вирусный ИИ
Федеративная сеть для геномного наблюдения и исследований инфекционных заболеваний
Просмотр, поиск и запрос коллекций вирусных геномов без перемещения исходных данных
Обмен данными между участвующими лабораториями и организациями общественного здравоохранения
Создано на основе стандартов GA4GH и других открытых геномных стандартов
Конфиденциальность, безопасность и совместимость встроены в платформу
Обработано и поделено более 1,6 миллиона геномов SARS-CoV-2
Поддерживает национальные развертывания геномного наблюдения, такие как у Genome Canada
Как использовать Вирусный ИИ?
Присоединиться как участвующая лаборатория: Подключите геномные данные организации к сети Вирусного ИИ.
Просматривать общие коллекции: Исследуйте наборы данных вирусных геномов, предоставленные другими участвующими лабораториями.
Искать и запрашивать: Находите конкретные последовательности или геномные паттерны по всей сети.
Отслеживать сигналы наблюдения: Следите за тенденциями в вирусных геномных данных, относящимися к исследовательскому вопросу.
Сохранять данные на месте: Данные остаются в своей системе, подключенные, но не скопированные, в рамках федеративной модели.
Варианты использования Вирусный ИИ
- Геномное наблюдение за пандемией
- Национальная геномная инфраструктура
- Кросс-лабораторные исследовательские запросы
