Описание
AlphaFold Server — это веб-сервис, который генерирует высокоточные прогнозы биомолекулярной структуры, включая белки, ДНК, РНК, лиганды и ионы. Он работает на основе последней модели AlphaFold 3, которая улучшает возможность моделирования сложных биомолекулярных взаимодействий. Пользователи могут вводить различные типы биологических молекул и получать подробные прогнозы о их структурах и взаимодействиях.
Читать далее
Сервер позволяет моделировать структуры, состоящие из нескольких биологических молекул, включая белки, ДНК, РНК и различные лиганды и ионы. Он поддерживает широкий спектр биологически распространенных лигандов и ионов, а также посттрансляционные модификации аминокислот и нуклеиновых кислот. Процесс моделирования ограничен системой токенов, где общий размер задания ограничен 5,000 токенами, что обеспечивает эффективную обработку и точные прогнозы.
AlphaFold Server предназначен для некоммерческого использования и требует от пользователей соблюдения определенных условий обслуживания. Пользователи могут выполнять до 30 заданий в день с возможностью сохранения заданий и их последующей отправки, если они превышают свою квоту. Сервер также предоставляет метрики уверенности для прогнозов, позволяя пользователям оценивать надежность сгенерированных структур. Эти метрики включают оценки pLDDT, PAE, pTM и ipTM, которые помогают пользователям интерпретировать точность предсказанных структур.
Для тех, кто заинтересован в настройке своих прогнозов, AlphaFold Server предлагает возможности использования пользовательских шаблонов и множественных выравниваний последовательностей (MSA). Пользователи могут загружать свои собственные шаблоны и MSA для улучшения процесса прогнозирования, что делает его универсальным инструментом для исследователей в области биомолекулярного моделирования.
- КатегорияНаучные открытия и лабораторные инструменты
- Модель ценообразованияБесплатно
- РазвёртываниеНа основе веб
- ПлатформыОблако
Основные функции AlphaFold Server
Точные прогнозы структуры
Поддержка белков, ДНК, РНК, лигандов, ионов
Доступны пользовательские шаблоны и MSA
Предоставляются метрики уверенности
Только для некоммерческого использования
Ограничение в 30 заданий в день
Лимит токенов 5000
Веб-интерфейс
Как использовать AlphaFold Server?
Введите типы биологических молекул: Введите желаемые белки, ДНК, РНК или лиганды.
Настройте шаблоны: Загрузите пользовательские шаблоны, если это необходимо для конкретных прогнозов.
Настройте MSA: Предоставьте пользовательские множественные выравнивания последовательностей для повышения точности прогнозирования.
Отправьте задание: Запустите задание на прогнозирование и дождитесь обработки результатов.
Варианты использования AlphaFold Server
- Моделирование взаимодействия белков
- Прогнозирование структуры ДНК
- Анализ взаимодействия РНК
- Исследования связывания лигандов
- Моделирование химических модификаций
