Description
Docking en un Clic — AutoDock Vina en Ligne fournit une plateforme fluide pour le docking moléculaire, éliminant le besoin d'installation locale ou de configuration Linux. Les utilisateurs peuvent saisir un ID PDB et des SMILES pour recevoir des résultats complets comprenant des tableaux d'affinité, des figures d'interaction 2D/3D et un PDF prêt pour une thèse.
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Le processus de docking implique plusieurs étapes : préparation du récepteur utilisant Biopython, préparation du ligand avec dimorphite-DL et RDKit, et docking utilisant AutoDock Vina. La plateforme prend en charge le docking avec récepteur rigide, garantissant que les chaînes latérales des protéines restent fixes tout en permettant la flexibilité du ligand. Les utilisateurs peuvent choisir parmi diverses sources de boîte pour définir la zone de recherche, et la plateforme fournit un aperçu 3D avant que les crédits ne soient dépensés.
Docking en un Clic propose un plan gratuit avec des crédits limités et plusieurs plans d'abonnement payants, y compris des plans Étudiant, Recherche et Laboratoire, chacun offrant différentes allocations de crédits et fonctionnalités. La plateforme propose également des packs de crédits ponctuels pour les utilisateurs qui ont besoin de ressources supplémentaires sans s'engager dans un abonnement.
Les résultats sont livrés dans un fichier ZIP complet contenant toutes les données nécessaires pour un travail hors ligne, y compris les meilleures poses, les complexes protéine-ligand et les diagrammes d'interaction. La plateforme propose également des ébauches de manuscrits AI optionnelles pour aider à générer des discussions et des légendes de figures, bien que celles-ci ne remplacent pas l'édition par des experts.
Dans l'ensemble, Docking en un Clic — AutoDock Vina en Ligne est un outil puissant pour le docking moléculaire, offrant aux utilisateurs une plateforme complète et facile à utiliser qui prend en charge un large éventail de besoins en docking.
- CatégorieDécouverte scientifique et outils de laboratoire
- Modèle tarifaireFreemium
- DéploiementCloud
- PlateformesWeb
Fonctionnalités principales de Docking en un Clic
Moteur AutoDock Vina
Docking par lots
Préparation PDB
Rapport PDF
Contrôle de qualité PoseBusters
Analyse ADMET
Diagrammes d'interaction
Dépistage virtuel
Niveau gratuit disponible
Plans d'abonnement
Comment utiliser Docking en un Clic ?
Saisir l'ID PDB : Saisissez un ID PDB de 4 caractères ou téléchargez un récepteur .pdb.
Soumettre les ligands : Fournissez des SMILES ou des ligands SDF pour le docking.
Exécuter la configuration de révision : Validez la configuration sans dépenser de crédits.
Exécuter le docking : Lancez le processus de docking et recevez les résultats.
Cas d'utilisation de Docking en un Clic
- Recherche Académique
- Découverte de Médicaments
- Analyse des Interactions Moléculaires
- Préparation de Thèse
- Dépistage Virtuel
