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Graphormer - Microsoft Research

Graphormer é um pacote de deep learning para tarefas de modelagem de moléculas, acelerando a pesquisa em descoberta de materiais e medicamentos. Ele suporta dinâmica molecular e predição de propriedades, com futuros aprimoramentos para predição de reações e modelagem de moléculas em larga escala. Ele supera as redes neurais de grafos convencionais em tarefas de predição em nível de grafo.

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Graphormer é um sofisticado pacote de deep learning projetado para capacitar pesquisadores e desenvolvedores no treinamento de modelos personalizados especificamente para tarefas de modelagem de moléculas. Seu objetivo principal é acelerar significativamente os avanços e aplicações em IA para a ciência de moléculas, abrangendo áreas críticas como descoberta de materiais e descoberta de medicamentos.

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Atualmente, o Graphormer oferece suporte robusto para uma variedade de tarefas de simulação de moléculas, incluindo dinâmica molecular e predição de propriedades. O roteiro de desenvolvimento indica futuras expansões para incluir aplicações cruciais como predição de reações, retrosíntese, geração de moléculas e modelagem de moléculas em larga escala, como polímeros e proteínas. Além disso, ele aprimorará as capacidades na predição de interação droga-proteína (DPI) e outras áreas vitais.

A base do Graphormer é detalhada no artigo da NeurIPS 2021, "Do Transformers Really Perform Badly for Graph Representation Learning?". A pesquisa introduziu o Graphormer como o primeiro modelo de deep learning construído em uma arquitetura Transformer padrão que supera demonstrativamente as redes neurais de grafos convencionais em tarefas de predição em nível de grafo. Essa abordagem inovadora levou a conquistas significativas.

O Graphormer alcançou o primeiro lugar na KDD Cup – OGB-LSC quantum chemistry track, uma competição focada no uso de IA para prever as propriedades quânticas de mais de 3,8 milhões de moléculas. Este evento contou com a participação de mais de 500 equipes, incluindo grandes players da indústria. Mais recentemente, o Graphormer garantiu a vitória na Open Catalyst Challenge, uma competição centrada na modelagem de sistemas de reação catalisador-absorvato impulsionada por IA. Este desafio envolveu a simulação de mais de 0,66 milhão de sistemas, destacando o potencial do Graphormer para impulsionar o progresso em IA para descoberta de materiais e campos relacionados.

Versões avançadas e pré-treinadas do Graphormer estão acessíveis através do Azure Quantum Elements, fornecendo um caminho simplificado para os pesquisadores aproveitarem suas capacidades. O projeto também é apoiado por documentação abrangente e um repositório GitHub para engajamento e desenvolvimento da comunidade.

  • CategoriaDescoberta científica e ferramentas de laboratório
  • Modelo de preçosCódigo aberto
  • ImplantaçãoNuvem
  • PlataformasWeb

  • Pacote de deep learning para modelagem de moléculas

  • Acelera a IA para descoberta de materiais e medicamentos

  • Suporta simulações de dinâmica molecular

  • Permite a predição de propriedades para moléculas

  • Arquitetura baseada em Transformer para aprendizado de representação de grafos

  • Supera redes neurais de grafos convencionais

  • Venceu a KDD Cup – OGB-LSC quantum chemistry track

  • Venceu a Open Catalyst Challenge

  • Suporte futuro para predição de reações

  • Suporte futuro para retrosíntese

  • Suporte futuro para geração de moléculas

  • Suporte futuro para modelagem de moléculas em larga escala (polímeros, proteínas)

  • Suporte futuro para predição de interação droga-proteína (DPI)

  1. Acessar modelo: Obtenha acesso ao Graphormer através do Azure Quantum Elements ou de seu repositório open-source.

  2. Configurar ambiente: Configure seu ambiente de desenvolvimento com os frameworks e bibliotecas de deep learning necessários.

  3. Integrar via API: Utilize as APIs fornecidas para incorporar o Graphormer em seus fluxos de trabalho de modelagem de moléculas.

  4. Treinar modelos personalizados: Desenvolva e treine modelos sob medida para tarefas específicas de simulação de moléculas.

  5. Otimizar desempenho: Ajuste os parâmetros e configurações do modelo para maior precisão e eficiência.

  6. Aplicar à pesquisa: Implante modelos treinados para descoberta de materiais, descoberta de medicamentos e outras aplicações científicas.

  • Descoberta de Materiais
  • Descoberta de Medicamentos
  • Dinâmica Molecular
  • Predição de Propriedades
  • Química Quântica
  • Modelagem de Catalisadores

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