Deskripsi
ESMFold2 adalah model prediksi struktur protein yang canggih yang memprediksi struktur 3D resolusi tinggi, semua atom langsung dari urutan asam amino. Sebagai penerus ESMFold, ini menetapkan standar baru untuk prediksi struktur urutan tunggal dan memungkinkan generasi protein fungsional baru melalui eksplorasi ruang laten model ESMC.
Baca Selengkapnya
Model ini dapat memanfaatkan input penyelarasan urutan ganda (MSA) opsional, yang secara signifikan meningkatkan akurasi, terutama pada target yang menantang. ESMFold2 menghasilkan informasi struktural yang komprehensif, termasuk koordinat semua atom untuk tulang punggung dan rantai samping, metrik kepercayaan, dan prediksi distogram opsional untuk analisis mendetail dari struktur yang diprediksi. Ini menjadikannya alat yang berharga bagi peneliti dan profesional di bidang ilmu protein.
Untuk memulai dengan ESMFold2, pengguna dapat merujuk ke Panduan Awal Cepat dan Tutorial yang tersedia di platform Biohub. Proses instalasi melibatkan pemasangan paket Python esm, membuat kunci API dari akun Biohub, dan menghubungkan ke API Platform Biohub. Setelah disiapkan, pengguna dapat menjalankan inferensi mereka dan menjelajahi berbagai kasus penggunaan, seperti melipat protein dalam kombinasi dengan DNA, RNA, dan ligan molekul kecil, atau merancang antibodi dan minibinder dengan tingkat keberhasilan tinggi.
ESMFold2 dilatih pada dataset yang luas, termasuk urutan dari Protein Data Bank (PDB) dan AlphaFold DB (AFDB). Namun, penting untuk dicatat bahwa model ini memprediksi konformasi statis tunggal dan tidak dirancang untuk memodelkan dinamika protein atau fleksibilitas konformasi. Output harus divalidasi secara eksperimental, dan tidak dimaksudkan untuk aplikasi klinis atau terapeutik tanpa validasi lebih lanjut. Secara keseluruhan, ESMFold2 mewakili kemajuan signifikan di bidang prediksi struktur protein, menawarkan peneliti alat yang kuat untuk menjelajahi struktur dan fungsi protein.
- KategoriPenemuan Ilmiah & Alat Laboratorium
- Model HargaGratis
- PenerapanCloud
- PlatformWeb
Sorotan Prediksi Struktur Protein ESMFold2
Prediksi struktur 3D resolusi tinggi
Model urutan tunggal dan model yang dikondisikan MSA
Output koordinat semua atom
Metrik kepercayaan termasuk
Prediksi distogram tersedia
Akses API untuk integrasi
Akses terbuka ke model
Dilatih pada dataset PDB dan AFDB
Memulai dengan Prediksi Struktur Protein ESMFold2
Instal paket Python esm: Ikuti petunjuk instalasi yang diberikan dalam Panduan Awal Cepat.
Buat kunci API: Hasilkan kunci API dari akun Biohub Anda untuk mengelola akses.
Hubungkan ke API Platform Biohub: Gunakan kunci API untuk mengautentikasi permintaan Anda.
Jalankan inferensi Anda: Panggil klien inferensi dengan model yang dipilih dan token API Anda.
Kasus Penggunaan Prediksi Struktur Protein ESMFold2
- Melipat Protein
- Desain Antibodi
- Analisis Struktural
- Generasi Protein Fungsional
- Aplikasi Penelitian
