Description
Viral AI est un réseau fédéré pour la surveillance génomique et la recherche sur les maladies infectieuses, construit par DNAstack sur sa plateforme Omics AI. Il offre aux chercheurs et aux laboratoires de santé publique un moyen de parcourir, rechercher et interroger des collections de génomes viraux partagées par des organisations contributrices à travers le monde.
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Étant donné que le réseau est fédéré, les laboratoires et agences participants se connectent et partagent des données sans les déplacer hors de leurs propres systèmes, ce qui permet aux données génomiques sensibles de rester sous le contrôle de leur propriétaire tout en étant découvrables et interrogeables à travers le réseau. La plateforme met en œuvre des normes ouvertes de la Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH) et d'autres organismes de normalisation reconnus, et est construite avec la confidentialité, la sécurité et l'interopérabilité comme objectifs de conception fondamentaux.
Viral AI a traité et partagé plus de 1,6 million de génomes SARS-CoV-2 à travers son réseau. Genome Canada, une organisation construite sur la plateforme Omics AI sous-jacente de DNAstack, l'a utilisée pour créer un système national, conforme à la GA4GH, basé sur le cloud pour le traitement et le partage de centaines de milliers de séquences virales.
Viral AI est conçu pour les chercheurs en génomique, les autorités de santé publique et les laboratoires contributrices travaillant sur la surveillance des maladies infectieuses, plutôt que pour les consommateurs généraux, et l'accès à la plateforme se fait à travers son réseau d'organisations contributrices plutôt que par le type d'inscription publique ouverte que l'on trouve sur une application grand public typique.
DNAstack décrit son approche plus large comme fédérée par conception : elle connecte, protège et permet des découvertes alimentées par l'IA à travers des ensembles de données distribués sans les déplacer hors de leurs systèmes sources. Viral AI est l'un des plusieurs réseaux de recherche que DNAstack alimente, aux côtés de réseaux structurés de manière similaire pour les neurosciences et d'autres domaines, tous construits sur la même plateforme Omics AI sous-jacente et le même engagement envers les normes ouvertes et l'interopérabilité que DNAstack applique à travers ses offres de réseau fédéré. Le propre catalogue de données de la plateforme le décrit simplement : surveillance génomique et données sur les maladies infectieuses, partagées ouvertement entre les laboratoires et agences qui choisissent de participer.
- CatégorieDécouverte scientifique et outils de laboratoire
- DéploiementCloud
- PlateformesWeb
Fonctionnalités principales de Viral AI
Réseau fédéré pour la surveillance génomique et la recherche sur les maladies infectieuses
Parcourir, rechercher et interroger des collections de génomes viraux sans déplacer les données sources
Partage de données entre laboratoires contributrices et organisations de santé publique
Construit sur les normes ouvertes GA4GH et d'autres normes génomiques
Confidentialité, sécurité et interopérabilité intégrées à la plateforme
A traité et partagé plus de 1,6 million de génomes SARS-CoV-2
Alimente des déploiements nationaux de surveillance génomique, comme celui de Genome Canada
Comment utiliser Viral AI ?
Rejoindre en tant que laboratoire contributif : Connecter les données génomiques d'une organisation au réseau Viral AI.
Parcourir les collections partagées : Explorer les ensembles de données de génomes viraux partagés par d'autres laboratoires contributifs.
Rechercher et interroger : Rechercher des séquences spécifiques ou des motifs génomiques à travers le réseau.
Suivre les signaux de surveillance : Suivre les tendances dans les données génomiques virales pertinentes pour une question de recherche.
Conserver les données sur place : Les données restent dans leur propre système, connectées mais non copiées, selon le modèle fédéré.
Cas d'utilisation de Viral AI
- Surveillance génomique pandémique
- Infrastructure génomique nationale
- Requêtes de recherche inter-laboratoires
